24個超標排放的陸源入海排污口鄰近海域環境監測結果表明，受陸源排污影響，約80％的入海排污口鄰近海域環境污染嚴重。其中劣於四類水質標準的海域面積約為100平方公里，佔入海排污口鄰近海域監測總面積的50％；大部分排污口鄰近海域的沉積物質量劣於海洋沉積物質量的三類標準，污染嚴重；海洋生物普遍受到污染，生物體內的糞大腸菌群絕大部分超過海洋生物質量二類標準；大部分海域大型底棲生物分布密度低，種類和數量少，生物多樣性低，約20平方公里的監測海域成為無底棲生物區。
入海污染物的排放還嚴重影響了鄰近的養殖區、保護區、濱海風景旅遊區等海洋功能區的功能。
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