6月6日有報導稱，陳用林事件已引發美澳關係緊張，原因是在澳洲拒絕陳的政庇申請後，陳又向美國提出了政庇申請，而美外交官卻完全不知這起爆炸性事件。然而美國對澳大利亞的指責似乎遠遠不止與此。儘管澳大利亞總理霍華德6月9日公開聲稱，陳用林一案與澳中關係無關。但《紐約時報》卻這樣評論稱，「澳大利亞政府已經竭盡所能的冷待了陳用林，他們害怕觸怒中國，因為對方已經成為澳最主要的礦物和其它能源的購買者。」
6月8日澳大利亞反對黨綠黨領導人布朗（Bob Brown）公開了陳用林向外長唐納（Alexander Downer）和總理霍華德提交的政治庇護申請信。美聯社6月9日引用陳用林在信中話說，「如果被強迫送回中國，我寧願去死。」多維社記者從網際網路上得到的資料顯示，陳用林在申請信中說，他在悉尼總領館工作的四年中「經常做惡夢」，他現在生命正處於危險之中。《紐約時報》披露，在暗中觀察、沉默良久的外長唐納終於在6月8日發話了。
「我覺得人們不要對此大驚小怪的。我覺得他們只是應該等待程序的完成。」外長唐納認為，聯邦政府已鼓勵陳用林去尋求一種永久的保護簽證。澳大利亞反對黨6 月8日敦促霍華德政府立即給逃離中國領事館的前外交官陳用林發放簽證。澳大利亞工黨外交事務發言人魯德（Kevin Rudd）6月8日指出，不管是哪類簽證，澳大利亞政府都需要向陳用林提供一種「越長越好」的保護。魯德說：「現在已到了立即向陳用林發放一種適當的保護簽證的時候了，也到了唐納外長停止與移民部長相互推諉的時候了。」
有消息表明，陳用林已經和美國使館取得了聯繫，然而具體的細節至今仍不可知。《紐約時報》記者博內爾認為，中國在東南亞的影響力日趨膨脹，被諸多媒體關注的陳的案例已經多少激怒了澳大利亞政府，緊接著被激怒的還有美國政府。顯然，或許如果中國大陸開始攻打臺灣的話澳大利亞不一定會站在臺灣那邊，這對於作為美國盟國的澳大利亞來說，恐怕會成為一件令人失望的事情。
而和6月5日拉姆斯菲爾德在新加坡發表的一番針對中國的言論相比，澳大利亞對中國的態度太軟，即使是在對華武器禁運的問題上，澳大利亞政府也站在支持歐盟解禁的立場上。報導說，作為緊密的盟友，美國和澳大利亞一直共享著機密情報，用間諜專家的話說，外交官「叛逃」事件始終都是罕見的「紅色代號」。《悉尼晨驅報》指出，近來，因霍華德政府與中國打得過於「火熱」，美國和澳大利亞也一直處於緊張狀態，尤其是唐納擔任澳大利亞外交部長以後，美澳關係變得更加冷淡。
澳洲廣播公司說，在陳用林披露中國有上千名間諜在澳大利亞活動後，另一名早已叛逃的中國前國家安全人員郝鳳軍也認為這一說法「屬實」。美國的意思也很明顯，情況已經如此嚴重，卻仍然不能批准陳用林的政治庇護申請，這樣的澳大利亞政府勢必受到了和中國經貿關係的制約，這樣的西方政府也叫人失望。
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