令人吃惊的是这些基因在比珊瑚高级的动物基因库中不存在，如果蝇和线虫等等。根据达尔文进化论，后者是在珊瑚出现几百万年以后才进化出来的。这一发现对用基因作模式研究进化提出质疑。
这项研究发表在现代生物学杂志上(D. Kortschak et al. 13, 2190–2195; 2003)。研究这检查了珊瑚的1，300个基因序列，其中有500个可以在基因数据库里查到同源序列。 其中有90%在人的基因库中可以找到同源基因。 但10%虽然存在于人体基因库中，但却在被认为是进化过程中的过渡物种的基因库中找不到，比如像果蝇和线虫。这一发现提示，有很多被认为是脊椎动物所特有的基因并非如此， 它们可能有更早起源，有些人也许这些基因在进化到线虫和果蝇时丢失了，而在进化到人时又重现出现了。
此外，他们还惊奇地发现， 在珊瑚的基因库里出 现了一些决定脊椎动物神经系统发育的一些基因。而这些基因对只有非常简单的神经网的珊瑚来说根本就不需要。脊椎动物所特有的基因被称为是“脊椎动物特有基因。” Utah 大学生物学家，Sanchez 在扁虫基因库中已发现同样的现象, 即非脊椎动物的扁虫也有“脊椎动物特有基因。” 有人认为这一现象对基因的“用进废退”的进化学说是一个挑战。
还有人对生物由于进化从而丢弃无用基因的说法也有争议，加州理工学院的Eric Davidson 说，我们只能通过比较更多的线虫和昆虫才能得到更多的信息。也有的科学家反对这一说法，认为这些低级动物的研究对人类很有限。他们觉得应该研究一些还有没有丢失这些基因的高级动物，才能进一步去理解人类这些基因的功能。
Nature 426, 744 (18 December 2003); doi:10.1038/426744a: Coral reveals ancient origins of human genes
标题系译者所加
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