有害的不是微波，是温度
师大化学系教授吴家诚指出，微波是一种电磁波，能量比一般可见光还要低，甚至低于红外线。
而要发生如食物变质等化学反应，需要比可见光还要高的能量。就这层次来说，微波是很安全的。
辅大食品科学系教授陈炳辉解释，传统的加热，热的传导是由外到内，但微波释放的能量直接穿透食物内部，让食物内的水分或有极性的分子震动，摩擦生热。因为是直接穿透，因此加热的时间短。台安医院营养师陈晓蒨指出，微波加热的时间短，营养素流失的比例反而相对少。
吴家诚指出，微波造成的不安全，如食物变质或者容器释出毒素等，不是因为“微波”本身，而是微波后的“温度”。这样的危险，在用电或用火加热，也可能存在。
例如，过度的加热或高温会伤害食物营养素。陈晓蒨举例，一般认为长时间加热蛋白质会产生致癌物质，但那是在“过度加热”的情况下，如果微波时间固定，且按照建议与指示加热，是没有问题的。
而不同材质的容器也有不同的耐热度；举例来说，塑胶就分成好几类，能承受的温度也不同。
安全而营养的食用微波食物
要安全健康地食用微波食品，专家们建议：
1 将微波拿来温热食物，不要拿来烹煮食物
吴家诚指出，食物里材料种类多，依据水分含量、极性高低、脂肪多寡等，加热容易的程度不同。而煮食物通常要花的微波时间长，容易造成食物中某些部份过热，营养价值流失。
2 正确使用容器与包材
不同的材质会对微波起不同的作用，也可能带来不同的危险性。
3 注意热量与摄取均衡
在安全性之外，陈晓蒨提醒，许多常吃微波食品的人都是外食族，要特别注意营养素和热量的均衡，例如吃一份冷冻义大利面时，可以多加一份生菜沙拉。
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